Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms