Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RarbP22605 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RarbP22605 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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