Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms