Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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