Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RhoP15409 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RhoP15409 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RhoP15409 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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