Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DmdP11531 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DmdP11531 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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