Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms