Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TtrP07309 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms