Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06323 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06323 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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