Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01745 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01745 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01745 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms