Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01680 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01680 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01680 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01680 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01680 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01680 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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