Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01648 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P01648 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P01648 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms