Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ccl20O89093 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ccl20O89093 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ccl20O89093 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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