Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms