Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copb2O55029 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copb2O55029 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Copb2O55029 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Copb2O55029 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms