Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lgals6O54891 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms