Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TsksO54887 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TsksO54887 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TsksO54887 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TsksO54887 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TsksO54887 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TsksO54887 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TsksO54887 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TsksO54887 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TsksO54887 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TsksO54887 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TsksO54887 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TsksO54887 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms