Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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DffaO54786 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffaO54786 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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DffaO54786 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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DffaO54786 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffaO54786 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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