Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Timm44O35857 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timm44O35857 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Timm44O35857 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms