Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms