Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TnxbO35452 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TnxbO35452 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
TnxbO35452 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms