Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmiO35309 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmiO35309 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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NmiO35309 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmiO35309 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmiO35309 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmiO35309 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmiO35309 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmiO35309 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms