Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ebi3O35228 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms