Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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