Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LhbO09108 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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LhbO09108 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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LhbO09108 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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LhbO09108 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LhbO09108 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LhbO09108 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms