Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CckarO08786 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CckarO08786 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CckarO08786 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CckarO08786 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CckarO08786 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CckarO08786 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms