Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sec22bO08547 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sec22bO08547 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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