Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms