Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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