Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm2888K7N746 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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