Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr38-201ENSMUST00000074499 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms