Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm5225J3QPL3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm5225J3QPL3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm5225J3QPL3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm5225J3QPL3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm5225J3QPL3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm5225J3QPL3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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