Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8356J3QPD3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms