Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms