Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms