Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms