Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms