Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21818J3KMS6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms