Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20696H3BJN7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms