Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp17ldG5E8G2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp17ldG5E8G2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms