Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zkscan2G3X952 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms