Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-M1F7CXU4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms