Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm8247F6VRJ8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms