Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5861F6VCN9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm5861F6VCN9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm5861F6VCN9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5861F6VCN9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5861F6VCN9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5861F6VCN9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms