Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pagr1bF6V0H0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms