Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms