Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm17727E9Q4V7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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