Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms