Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde2E9PUP1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms