Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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BC035044E0CXF8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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BC035044E0CXF8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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BC035044E0CXF8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC035044E0CXF8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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